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    伯乐生命医学

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一些期刊、出版集团及学术组织对Blot/Gel图片的相关要求

2579 人阅读发布时间:2024-08-14 16:33

包含Frontiers、Plos One、PLOS Biology、Journal of Integrative Neuroscience、International Journal of Cancer、Journal of Molecular and Cellular Cardiology、International Journal of Molecular Sciences、International Journal of Cancer、Stem Cell Research & Therapy、Nature Methods、Molecules and Cells、JHEP Reports、Journal of Endocrinology、Journal of Thoracic Disease、Open Biology、Journal of Neuroinflammation、ACR Open Rheumatology、Biomolecules and Biomedicine、PeerJ、Cellular and Molecular Neurobiology、American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine、Journal of General Physiology等。

 

如果您希望将数据保留在实验室内,请咨询您的资助者和/或大学以获取具体说明。例如,伦敦大学学院 (UCL) 规定数据应从提交之日起保留 10 年,而美国国立卫生研究院 (NIH) 规定为 3 年。如果您的资助者/大学没有特定的数据保留政策,您应该谨慎行事,将数据保留 10 年。每年都有许多论文被撤回,因为作者无法提供原始数据。

 

1. Frontiers 非常重视图像处理问题。我们不接受对图像中的个别特征进行修改(包括增强、模糊、移动、回收、删除或添加)。图像处理方法(例如更改亮度、对比度或色彩平衡)必须应用于图像中的每个像素,并且更改不应改变图中所示的信息。对于凝胶和印迹,应尽可能避免使用裁剪图像。如果在图中显示裁剪图像,则必须提交整个原始凝胶的完整扫描图作为补充材料的一部分。如果为了说明目的而重新使用对照图像,则必须在图例中明确说明。如果为了解释数据而合法需要任何形式的图像处理,则必须在手稿的方法部分中声明软件和增强技术。必须在手稿和图文本中明确说明图像分组和拼接。

 

2. Plos One作者必须提供原始、未裁剪且经过最低限度调整的图像,以支持文章图表和支持信息文件中报告的所有印迹和凝胶结果。虽然在首次提交时不需要提供原始图像,但我们会在同行评审过程中或在稿件被接受之前要求提供这些文件。

 

 

3. PLOS Biology每个印迹的原始未裁剪图像应在附录中发表或存放在公共存储库中。源数据印迹应以将其链接到特定图形、面板和蛋白质的方式命名。裁剪的轮廓应在原始图像上标注。

 

4. Journal of Integrative Neuroscience印迹和凝胶原始图像要求:为了确保印迹技术(包括但不限于蛋白质印迹)和凝胶数据报告的完整性和科学性,应在初次提交稿件时将原始、未裁剪和未调整的图像作为支持信息文件上传。

 

5. International Journal of Cancer。对于所有免疫印迹图像:在一个 pdf 文件中清晰标记未裁剪、未处理的原始印迹,包括分子量标记。请确保提供来自与实验样品相同的凝胶/印迹的正确上样对照的原始数据,即使在手稿图中仅显示一个代表性上样对照。

 

6. Journal of Molecular and Cellular Cardiology。如果论文中使用了补充材料,则包括原始的、未裁剪的印迹图或凝胶图

 

7. International Journal of Molecular Sciences。蛋白质印迹图像应足够大,以便看清相关特征。此外,应将未裁剪、未处理的完整原始蛋白质印迹图像与其他图形文件一起上传。

 

8. International Journal of Cancer如果稿件中的图片包含免疫印迹图像,我们会要求作者提交未裁剪的原始印迹图作为支持材料,以及论文的修订版。即使在最终稿件图中仅显示一个代表性的上样对照,也必须提供来自实验样品的同一凝胶/印迹图的原始上样对照。在审核过程中或最终质量控制阶段,我们可能会随时要求提供额外的原始数据或图像。

 

9. Stem Cell Research & Therapy。图像完整性和标准:如果裁剪后的凝胶和印迹图能提高展示的清晰度和简洁性,则可以将其包含在正文中。在这种情况下,印迹图的裁剪必须清晰可见,并且必须在图例中提及。相应的未裁剪的全长凝胶和印迹图必须包含在补充文件中。这些未裁剪的图像应标明裁剪的位置,并在正文中标注,并放在单个补充图中。稿件的图例应说明“全长印迹图/凝胶在补充图 X 中呈现”。更多信息可在“数字图像完整性”下找到,详情请参阅我们的报告标准页面。

 

10. Nature Methods。如果可以提高展示的清晰度和简洁性,则鼓励在主论文中显示裁剪的凝胶和印迹。在这种情况下,必须在图例中提及裁剪,补充信息应尽可能包括全长凝胶和印迹。这些未裁剪的图像应标记为正文中的图像,并放置在单个补充图中。稿件的图例应说明“全长印迹/凝胶显示在补充图 X 中。” 

 

11. Molecules and Cells。鼓励您将用于创建稿件中所有图表的原始数据作为补充数据发布,或声明所有数据均可在“数据和代码可用性”中根据要求提供(请参阅下面的示例说明)。所有蛋白质印迹的未裁剪扫描和用于创建所有图表的所有原始数据均可在数据 S1 中找到。

 

12. JHEP Reports。如果可以提高展示的清晰度和简洁性,我们鼓励在主论文中展示裁剪的凝胶和印迹。在这种情况下,必须在图例中提及裁剪。对于蛋白质印迹,必须提供原始印迹作为补充材料。

 

13. Journal of Endocrinology。以下准则适用于凝胶电泳和印迹程序产生的数字图像:应从几个独立实验中量化条带强度。如果图中仅显示“典型”实验,作者应准备根据主编的要求提供未经处理的凝胶或印迹图像。不接受大量裁剪的图像,可以裁剪图像以增强呈现的清晰度,但应始终包含至少两个标记(一个比目标条带分子尺寸小,一个比目标条带分子尺寸大),并标明其分子尺寸。

 

14. Journal of Thoracic Disease。值得单独说明的是,Western Blot 图的问题在学术界发表的研究中尤为严重。为了进一步提高研究中使用 Western Blot 实验时 Western Blot 图的报告透明度,我们强烈建议其报告采用以下几项建议。确保读者可以访问原始数据。作者可以在附录中提供未经裁剪或任何其他处理的原始图像。

15. Open Biology。作者在提交时必须提交底层原始图像以支持所有印迹和凝胶图像数据。每张凝胶和印迹图上都应包括阳性和阴性对照以及分子量标记 - 无论是在主图还是扩展数据补充图中(以 pptx 或 pdf 格式组装的已处理过的图像,如果没有原始标签则不合适)。

 

16. Journal of Neuroinflammation对于包含凝胶或蛋白质印迹图像的任何投稿,作者需要在投稿时将原始图像文件作为补充文件。否则可能会导致稿件审阅延迟。

 

17. ACR Open Rheumatology。对于任何包含裁剪凝胶或免疫印迹的修订稿,请上传单独的 PDF、PPT 或 PPTX 文件(与提供的任何其他补充材料不同),该文件显示整个未编辑(未剪裁)的凝胶。清楚地指出图中使用了哪些条带。这些将与稿件一起存档。

 

18. Biomolecules and Biomedicine。对印迹和凝胶图像结果实施以下质量和透明度政策,以确保印迹/凝胶数据报告的完整性和科学有效性。作者必须在同行评审过程中或稿件被接受之前提供原始、未裁剪、未调整或以其他方式处理的图像。编辑部将通过电子邮件联系作者提供图像,如果文件较大,则使用适当的文件传输服务。

19. PeerJ。电泳凝胶、印迹和色谱图:仅在提高清晰度的情况下,才在文章中使用裁剪的凝胶、印迹、纸和薄层色谱图等。如果这样做,请将凝胶、印迹和色谱图的全长图像作为补充文件上传。

 

20. Cellular and Molecular Neurobiology。请将所有原始蛋白质印迹的副本作为补充材料附上,这些副本应显示整个印迹中观察到的所有蛋白质条带以及整个实验中相应的蛋白质梯状图。所有原始蛋白质印迹的完整副本必须包含在主文件中,并应在主文件中引用。

 

21. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine。电子版提交的图片必须准确呈现实际研究图像。图片中的特定特征不得增强、模糊、移动、删除或添加。来自同一凝胶的不同部分或来自不同凝胶、区域或曝光的图像的分组必须使用分界线(或其他图形划分方式)明确,并且还必须在图例中说明。亮度、对比度或色彩平衡的调整如果应用于整个图像是可以接受的,只要这些技术不会模糊、消除或歪曲原始图像中存在的任何信息,包括背景(背景不应淡化到无法检测到的程度)。非线性调整(例如,更改伽马设置)以及其他操作(如伪彩色)必须在图例中披露。如果对图片有任何疑问,编辑可以随时联系通讯作者,即使在文章发表之后。所有论文都要接受常规法医分析。如果论文被暂时接受,作者必须在 7 天内提交所有数据和原始印迹(如有要求)。

 

22. Journal of General Physiology。图像应经过最少处理,并准确反映原始数据。我们理解图像处理通常是必要且适当的,但在这种情况下,我们鼓励(有时要求)将未经处理的图像(包括全长印迹和凝胶)作为补充材料发表。

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